ساختار شیشه سیلیکا ذوبی آرام است و به یونهای گازهای خاص اجازه میدهد تا در دماهای بالا از طریق شبکه آن نفوذ کنند، که در این میان نفوذ یون سدیم نسبتاً سریع است.
این ویژگی شیشه سیلیکا ذوبی برای کاربران بسیار مهم است. به عنوان مثال، هنگامی که از شیشه سیلیکا ذوبی به عنوان ظروف با دمای بالا یا لولههای انتشار در صنعت نیمهرسانا استفاده میشود، مواد نیمهرسانا به خلوص بسیار بالایی نیاز دارند. بنابراین، مواد نسوز مورد استفاده به عنوان آستر کوره که با شیشه سیلیکا ذوبی در تماس هستند، باید قبل از قرار گرفتن در داخل شیشه سیلیکا ذوبی برای استفاده، تحت عملیات دمای بالا و تمیز کردن قرار گیرند تا ناخالصیهای قلیایی مانند پتاسیم و سدیم حذف شوند.
در دمای اتاق، شیشه سیلیکا ذوبی را میتوان نسبت به گازها غیرقابل نفوذ در نظر گرفت. حتی در دماهای بالا (به عنوان مثال، 700 درجه سانتیگراد)، ثابتهای نفوذپذیری گازهای خاص بسیار کم هستند. از این رو، میتوان از آن در تجهیزات با دمای بالا و خلاء بالا استفاده کرد.